Parede de azulejos numa igreja

As igrejas barrocas cobriam todas as superfícies, incluindo tetos e abóbadas, e a azulejaria complementava a talha dourada. A Wikipédia em português agrupa a azulejaria de igreja por tipos: o enxaquetado, em xadrez, em Santa Maria de Marvila (Santarém), São Quintino (Sobral de Monte Agraço) e Jesus (Setúbal); o azulejo de tapete, em Carcavelos, Alcáçovas e Cuba; e os frontais de altar, como no Hospital de Santa Marta, em Lisboa, e no Convento de Santa Cruz do Buçaco.

Há grotescos na Ermida de Santo Amaro, em Santarém, e no Convento da Graça, em Lisboa. A capela de São Roque, em Lisboa, é de Francisco de Matos, 1584; as paredes laterais ficaram danificadas no terramoto de 1755 e só a parte inferior se manteve intacta. O Museu Nacional do Azulejo ocupa um convento construído em 1509, o da Madre de Deus, com azulejos mouriscos nas paredes que levam à igreja e um interior barroco de talha dourada. No norte, o azulejo foi também aplicado nos exteriores: a Capela das Almas, no Porto, revestida em 1929, e Santo Ildefonso, de fachada com cerca de 11 000 azulejos de Jorge Colaço.